La pérdida de fondos comunitarios en el período 2007-2013 llegará a suponer que hasta 2013 se dejarán de crear 268.679 puestos de trabajo y se perderán de 15.051 millones de euros de capital público, según un estudio de la Fundación para el Análisis y los Estudios Sociales (FAES). Según este estudio la negociación de los fondos europeos que desarrolló el Gobierno central en 2005 "se saldó con un resultado económico cifrado en la pérdida de 30.433 millones de euros en fondos comunitarios en comparación con los conseguidos por el anterior Gobierno en la negociación de las perspectivas financieras 2000-2006".
El estudio, llamado 'Las consecuencias económicas de la negociación de las perspectivas financieras 2007-2013', ha sido elaborado por los profesores Rafael Flores de Frutos, catedrático de Econometría de la Universidad Complutense de Madrid; Juan José Rubio, catedrático de Hacienda Pública de la Universidad de Castilla-La Mancha; Calixto Sánchez-Fresneda, licenciado en Ciencias Geológicas; José Félix Sanz, catedrático de Economía Aplicada de la Complutense. De esta forma, según este estudio, el impacto económico de la pérdida de fondos europeos se cifra en 2009 en 408 euros de pérdida acumulada de renta per capita, mientras que en 2013 alcanzará los 2.681 euros per capita. Asimismo, las pérdidas de empleo se cifran en un 1,96 por ciento de la población ocupada en 2009, mientras que en 2013 la pérdida de fondos comunitarios llegará a suponer un impacto negativo sobre el empleo equivalente al 8,8 por ciento de la actual población ocupada, el segundo impacto en importancia de todas las comunidades, solo superado por Canarias (10,45 por ciento en 2013).
Así, FAES indicó que en 2009 se han perdido como consecuencia de la negociación de la perspectiva financiera 2007-2013 un total de 60.014 empleos en Andalucía y se han perdido 4.023,5 millones de euros de capital público hasta 2009, ambas cifras las más elevadas del conjunto de comunidades autónomas. Asimismo, apuntó que hasta 2009 se han perdido 4.013 millones de euros en infraestructuras.
En cuanto a las previsiones hasta 2013, la fundación estima que se perderán 268.679 empleos hasta esa fecha y 15.051,3 millones de euros de capital público, cifras ambas que colocan a Andalucía como la comunidad que más puestos de trabajo y capital público perdería entre 2007 y 2013 con motivo de la aplicación de los fondos comunitarios en ese período. El estudio asimismo aseguró que en 2008 "con la pérdida de fondos comunitarios durante las negociaciones de las perspectivas 2007-2013, el PIB per capita ha descendido en 118 euros en comparación con una hipotética negociación donde no se hubieran registrado pérdidas de fondos comunitarios, los parados han aumentado en 20.729 desempleados y la tasa de paro ha aumentado un 0,53 por ciento en relación con la posible situación en la que no se hubieran perdido fondos".